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Reagenzien und Instrumente für die Immunologie Zellbiologie und Molekularbiologie

Sarkomdiagnostik in einer einzigen Reaktion

SarcomaFusion: Molekulardiagnostischer Test für Sarkome

Fusions-Transkripte werden in etwa einem Drittel der Weichgewebs-Tumore gefunden, und bis heute hat die Literatur mehr als 210 Fusionen beschrieben. Sie sind oft mit einem bestimmten histologischen Subtyp assoziiert und folglich mit spezifischen Behandlungen. Daher stellen sie ideale molekulare diagnostische Marker dar.

Die Detektion dieser Fusions-Transkripte ist essenziell für das Patientenmanagement.

Der SarcomaFusion-Test ermöglicht die Detektion von Fusions-Transkripten, die in Sarkomen identifiziert wurden, in einem einzigen Test.

Dieser Test ist CE-IVD-markiert für in vitro-diagnostische Verwendung und gewährleistet die Einhaltung europäischer Sicherheits- und Leistungsanforderungen.

Beispiele für Fusions-Transkripte

Alveoläres Rhabdomyosarkom

Fusionen PAX3::FOXO1 und PAX3::NCOA1
Mögliche Behandlungen:
- Chemotherapie
- Pazopanib (PDGFa, VEGF-1)
- Sorafenib (PDGFR, VEGFR, MAPK)
- Crizotinib (MET, ALK, ROS1)
- Temsirolimus (mTOR)
- Cixutumumab (IGF-1R)
- Strahlentherapie

Ewing-Sarkom

Fusionen EWSR1::FLI1, EWSR1::ETV1, EWSR1::FEV und andere EWSR1-Partner
Mögliche Behandlungen:
- Chirurgie
- Chemotherapie
- Strahlentherapie
- CAR-T-Zelltherapie

Epitheloides Hämangiom

Fusion ACTB::FOSB
Mögliche Behandlungen:
- Chirurgie
- Chemotherapie
- Strahlentherapie

Testmerkmale Technische Spezifikationen Dokumentation Ressourcen

Testmerkmale

SarcomaFusion ist ein einzigartiger, hochrobuster und sensibler Test, der für Pathologen und Molekularbiologen konzipiert ist.

Basierend auf der ligationsabhängigen PCR-Technologie (RT-MLPSeq) ermöglicht dieser Test die Detektion von Fusions-Transkripten aus frischen, gefrorenen oder paraffinierten Proben unter 210 möglichen Fusionen in einer einzigen Reaktion.

Die Einfachheit des Tests ermöglicht Ergebnisse innerhalb von 24 Stunden aus Tumor-RNA. Zusätzlich bedeutet die minimale Menge an Tumor-RNA, die erforderlich ist, dass eine Nadelbiopsie ausreicht, um Ergebnisse zu erzielen.

SarcomaFusion enthält eine GAPDH-Kontrolle, um den Erfolg des Verfahrens zu gewährleisten.

Was ist RT-MLPSeq?

Liste der Sonden

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Der SarcomaFusion-Test enthält Sonden, die spezifisch für die linken und rechten Partner von Fusions-Transkripten sind, die in der Literatur mit Sarkomen assoziiert werden.

Schlüsselmerkmale des Protokolls

In-Vitro-Test

Vier Haupt-Schritte
Ein halber Tag, einschließlich 1 bis 1,5 Stunden tatsächlicher Handhabung
Hohe Sensitivität aufgrund kurzer Sonden
Optimiert für FFPE-Proben

Sequenzierung

Kompatibel mit Illumina-Technologie
Sequenzierung mit anderen Bibliotheken möglich
Nur 100.000 Reads pro Probe erforderlich

Analyse

Erhöhte Spezifität durch UMIs
Bioinformatische Analyse inklusive
Zugang zu allen Rohdaten

Die Broschüre herunterladen

Technische Spezifikationen

Krebsart	Sarkome
Anwendungsbereich	Detektion von Fusions-Transkripten
Verfahrensdauer	Etwa 5,5 Stunden (ohne Sequenzierung)
Tatsächliche Arbeitszeit	Etwa 1 bis 1,5 Stunden (ohne Sequenzierung)
Probenarten	Frische, gefrorene oder fixierte und paraffiniert eingebettete Gewebebiopsien
Eingangsmenge	Zwischen 50 und 500 ng RNA in einem 2,5 µL Volumen
Reagenzieninhalt	Sonden, die über 210 Fusions-Transkripte anvisieren, Barcodes, Sequenzierungsprimer
Ausrüstungskompatibilität	Illumina®-Sequenzierer
Bioinformatische Analyse	Zugang zur RT-MIS-Analyseplattform inklusive
Zugängliche Daten	Grafische Darstellung der detektierten Fusions-Transkripte, assoziierte Bibliografie und vollständige Rohdaten (CSV)

Kit-Zusammensetzung

Kit-Inhalt:

RT-MLPA-Sonden-Mix
Genexpath-Barcodes
Genexpath-GAPDH-Kontroll-Barcodes
Sequenzierungsprimer

Verfügbar für 8, 16, 24 oder 48 Analysen

Erhaltene Ergebnisse

Sobald Ihre FASTQ-Datei auf die Plattform hochgeladen wird, führt RT-MIS Demultiplexing und Detektion von Fusions-Transkripten durch. Positive Ergebnisse werden wie folgt angezeigt:

Ein Musterbericht herunterladen

SarcomaFusion-Dokumentation abrufen

Formular zur Vervollständigung, um auf die Dokumentation zuzugreifen.

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